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BOTANIC-0: a series of foundation models for plant genomic data
本論文は、43 種の多様な植物ゲノムで事前学習された 1 億から 10 億パラメータ規模の植物用基盤モデル「Botanic0」シリーズを開発し、ゼロショットおよび微調整後のさまざまなゲノム予測タスクにおいて最先端の性能を達成し、作物改良やゲノム編集研究の進展に貢献することを報告しています。
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259 件の論文
植物生物学は、花が咲く仕組みから根が土から栄養を吸い上げる過程まで、植物の命を支えるあらゆるメカニズムを探求する分野です。Gist.Scienceでは、この分野で最先端の研究を迅速に届けます。
当サイトでは、bioRxiv に投稿された全ての新しいプレプリントを網羅的に処理しています。専門用語で書かれた複雑な論文を、誰もが理解できる平易な解説と、詳細な技術的サマリーの両面で提供し、科学の最先端を身近に感じられるよう努めています。
以下に、植物生物学に関する最新のプレプリント論文リストを掲載します。
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Molecular and phenotypic footprints of climate in native Arabidopsis thaliana
本研究は、自然環境下での Arabidopsis thaliana の大規模な表現型とトランスクリプトームデータを統合し、機械学習を用いて温度応答や他の形質を制御する遺伝子因子を予測・同定することで、気候変動を考慮した植物機能ゲノミクス研究の新たな枠組み「景観トランスクリプトミクス」の実用可能性を示しました。
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Semi-automated image analysis of root architecture and early root development in faba bean and white clover and genomic estimation of breeding values and correlations
この論文は、半自動画像解析を用いたルーツボックスによる早期根の発育評価が、ノルウェーなどの北欧条件におけるソラマメとクローバーの品種改良において、圃場収量と高い遺伝的相関を示し、気候変動に強い品種の育種に有効であることを示しています。
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Stem photosynthesis is coordinated with seasonal growth activity in two temperate tree species
本論文は、カエデとサクラの 2 種における茎の光合成が季節的に成長活動や水分状態と密接に連動して変動し、葉緑素含有量よりもこれらの生理的要因が季節変化をより強く説明することを明らかにしている。
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Metabolic trade-offs in sugar beet under drought and beet leaf miner infestation: implications for herbivore success
本論文は、気候変動に伴う干ばつがテンサイの代謝と揮発性有機化合物の放出に与える影響を解析し、干ばつの強度に応じて葉の栄養価と害虫の検知性の間でトレードオフが生じ、それがテンサイハモグリバエの成虫の産卵行動や幼虫の成長に異なる影響を与えることを明らかにした。
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THE GEOGRAPHIC STRUCTRUE OF CHLOROPLAST CAPTURE IN A HYBRID ZONE
この論文は、北米のハイブリッドゾーンにおけるシロバナツリフネソウ属（Heuchera）の集団遺伝学的サンプリングを通じて、氷河期の気候変動が東部での局所的な交雑と細胞質遺伝子の一方的な流入を引き起こし、現在ではそのハイブリッド遺伝子型が広範囲に分布するに至ったことを明らかにし、気候不安定性が種間交雑の主要な駆動力であることを示しています。
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How many bromeliads are there?
この論文は、過去数世紀にわたるブロメリア科の種記述の歴史的変遷を分析し、ロジスティックモデルを用いて未発見種を含めた総種数を約 6,658〜7,498 種と推定し、ブラジル、メキシコ、アンデス地域が将来の種発見のホットスポットであることを明らかにしています。
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Begonia manicata genome sequence reveals genetic basis underlying ornamental pigmentation
本論文は、ベゴニア・マニカータのゲノム配列を解読し、葉や茎から現れる赤い構造物の色素がアントシアニンの蓄積によるものであることを示す遺伝的基盤を明らかにしたものである。
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Investigating the landscape of plant-pollinator interactions in a hybrid zone
ハイブリッド帯における植物・送粉者相互作用の調査により、Heuchera 属の種間交雑頻度が高いことは、花の揮発性有機化合物（VOCs）や送粉者群集の種間分化が低い（保存的である）ことと関連しており、これが前接的隔離の制約によるものかもしれないという知見が得られました。
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Genomic analyses demonstrate the absence of genetic sex determination in the dioecious conifer Taxus baccata
この論文は、雌雄異株の針葉樹イチイ（Taxus baccata）において、これまで植物で確認されてきた遺伝的性決定領域の存在が示されず、性別決定が遺伝子ではなくエピ遺伝的なメカニズムによる可能性が高いことを、ゲノム解析を通じて初めて明らかにしたものである。